Bem, para o primeiro link que você postou, você está alterando os sistemas operacionais, é muito fácil fazer alguma coisa durante a instalação do SO que irá reformatar o disco rígido e não há como recuperar seus dados depois que isso acontecer.
Para responder à pergunta em geral, tudo pode acontecer ao instalar o software, especialmente se o software que você está instalando for secretamente malicioso. Quando você instala o software, geralmente está realizando essa ação como administrador, para que qualquer coisa possa acontecer que o administrador possa fazer, que é tudo.
Agora a questão é que o software que você está instalando vai fazer algo ruim? Bem, isso é mais difícil de responder, e é mais um julgamento pessoal sobre o quão bem você conhece o fornecedor do software e obteve uma cópia do software de uma fonte respeitável para que você saiba que ele não foi modificado antes de chegar até você. / p>