GDDR é a memória na placa gráfica. O que você precisa para se certificar é compatível é o slot da placa PCIe na sua placa-mãe. DDR3 é a memória do sistema, que usa um barramento completamente diferente da memória gráfica. Você não precisa se preocupar com problemas além de sua placa-mãe ter o slot PCIe correto para essa placa.