Aparentemente, o roteiro do café npm está quebrado. Eu tentei no meu sistema usando tanto a instalação global e local e não funcionam. Felizmente você pode usar o pacote coffeescript
do apt-get:
sudo apt-get install coffeescript
No meu caso, instalei a versão 1.4.0. É um preço justo por ter algo funcionando:
coffee --version
CoffeeScript version 1.4.0