Eu pessoalmente apoio o uso do wubi (como uma alternativa à virtualização) para determinar se você gosta do Ubuntu e se ele funciona no seu hardware. Pessoalmente, meu conselho é que, se você gosta do Ubuntu eu aconselho você a fazer uma instalação "padrão", você está a meio caminho, você já particionou o seu disco rígido.
De qualquer forma, seu problema está no tamanho padrão do disco virtual do wubi. O loop Wubi monta um arquivo e você precisa aumentar o tamanho do arquivo.
Veja o post mais excelente da bcbc nos formulários do Ubuntu para um passeio. Só você pode decidir se é mais fácil manter / redimensionar sua instalação do wubi ou começar do zero.