Eu tenho o mesmo problema. O meu às vezes trava completamente e é definitivamente o mesmo problema com o conteúdo complexo da janela sendo desenhado lentamente. A abertura do IE às vezes trava completamente.
Prometo retornar e postar uma resposta. Todos os tópicos sobre isso na web estão mortos!
NÃO corrigir
Para mim, este foi um caso de um driver gráfico ruim (padrão MS) para o IBM eServer 326m que estou executando. Desde que foi para o Win 2008, precisou ser reenquadrado para o motorista.
No caso improvável, seu servidor também possui uma ATI ES1000:
link
* UPDATE 1
Isso realmente não resolveu. Rolagem no IE não é um bom teste. Parece que ele não gosta de desenhar os snap-ins do MMC do Windows 2008 e a conexão inteira trava quando há muitos abertos.
FIX (PROPER)
HKEY_LOCAL_MACHINE \ SYSTEM \ CurrentControlSet \ Services \ Tcpip \ Parameters
DWORD, DisableTaskOffload. Defina seu valor para 1.
Ah sim !!!!!