Se você puder, certifique-se de ter uma boa infra-estrutura NTP (eu costumo usar uma fonte NTP externa ou apontar tudo para um switch ou roteador central) e ter coisas básicas como os relógios de hardware dos hosts ESXi configurados e fechados Tempo. Às vezes, um vMotion para um host diferente com distorção de clock de hardware pode acionar os problemas que você está vendo nas máquinas virtuais.
Quanto à abordagem das ferramentas de convidados, é um pouco hacky. E se você tiver VMs que não executam ferramentas de convidado (situações de sistema operacional ou dispositivo não suportadas) ou se suas ferramentas de convidado estiverem em um estado não ideal (por exemplo, o VMware Tools após uma atualização do kernel do Linux).