Alguns controladores permitem o flash drive de firmware com utilitários integrados (adaptec não tem certeza), mas de qualquer forma - não é seguro, especialmente para matrizes. Até mesmo utilitários podem fazer isso - eu não vou fazer isso.
É melhor atualizar as unidades uma por uma e reconstruí-las. Há um risco de que as unidades possam não funcionar após o flash do firmware e no caso de atualização em lote - você pode perder várias unidades de uma só vez e, como resultado, perder dados RAID inteiros, sem falar em unidades únicas.
Para unidades SAS - consulte seu fornecedor de discos e controladores para obter compatibilidade. Não há adaptadores genéricos e USB-SAS (não foi possível encontrar ou ser visto após a pesquisa, eles também precisam ser apagados com segurança). Para SATA - basta conectá-los ao seu desktop via cabo SATA / eSATA ou usar o adaptador como você já disse. Eu tenho alguns desses adaptadores chineses multimarcas e eles estão funcionando bem o suficiente - eu atualizei o firmware em muitas unidades SATA.
Boa sorte