Você usa o nome ao qual o serviço é acessado. Portanto, se seus clientes do portal visitarem o link , use portal.dlinkddns.com. E se eles visitarem o link , use portal.company.com.
Se seus clientes acessarem ambos, obtenha um certificado com um dos nomes como DN e o outro como subjectAltName, para que possa ser usado para ambos.
Se eu estiver lendo corretamente nas entrelinhas da sua pergunta, tudo o que será acessado em um navegador é o link . caso: obtenha um certificado para esse nome.