A descrição da configuração, como visto no próprio artigo ao qual você se vinculou, diz:
Enabling NTFS long paths will allow manifested win32 applications and Windows Store applications to access paths beyond the normal 260 char limit per node. Enabling this setting will cause the long paths to be accessible within the process.
Isso significa que, mesmo depois de ativá-lo, nem todos os aplicativos começarão, magicamente, a acessar caminhos longos. Cada aplicativo específico ainda precisa ser codificado para "aceitar" esse suporte.
No momento da redação deste artigo, o Explorer.exe e o cmd.exe não estão tirando proveito disso ainda . (Mas eles vão, eventualmente ... apenas dar tempo.)
Mas eu vi o Powershell aproveitando o novo recurso:
