Resolvido!
O problema principal foi o query_cache. link
Depois de desativá-lo, o "congelamento" desaparece.
Estou tentando consertar a configuração do MySQL em nosso servidor. A especificidade do nosso aplicativo é que muitos dados são armazenados em uma única tabela (atualmente mais de 300 milhões de linhas). Esta tabela é usada frequentemente para inserções (elas vêm o tempo todo).
Quando executo uma consulta de seleção nessa tabela que leva mais tempo do que alguns segundos, todas as inserções (comissões precisas) aguardam o acesso à tabela e fazem com que o aplicativo não responda.
Até onde eu sei, o InnoDB não faz nenhum bloqueio na tabela quando o select está rodando. Por que a tabela de bloqueio de seleção é então?
Eu tentei encontrar uma razão com o innotop, mas não tenho certeza de como interpretar sua saída e onde pesquisar. Diga-me o que você precisa e eu vou postar aqui.
+-----+---------+-----------+--------+---------+------+----------------+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| Id | User | Host | db | Command | Time | State | Info |
+-----+---------+-----------+--------+---------+------+----------------+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| 1 | root | localhost | dbname | Query | 29 | NULL | COMMIT |
| 2 | root | localhost | dbname | Query | 30 | NULL | COMMIT |
| 4 | root | localhost | dbname | Query | 29 | NULL | COMMIT |
| 5 | root | localhost | dbname | Query | 29 | NULL | COMMIT |
| 6 | root | localhost | dbname | Query | 25 | NULL | COMMIT |
| 7 | root | localhost | dbname | Query | 0 | NULL | show full processlist |
| 13 | user | localhost | dbname | Query | 25 | NULL | COMMIT |
| 38 | user | localhost | dbname | Sleep | 0 | | NULL |
| 39 | user | localhost | dbname | Sleep | 9017 | | NULL |
| 40 | user | localhost | dbname | Query | 33 | Sorting result | SELECT * FROM 'large_table' WHERE ('large_table'.'hotspot_id' = 3000064) ORDER BY discovered_at LIMIT 799000, 1000 |
| 60 | user | localhost | dbname | Sleep | 1033 | | NULL |
| 83 | root | localhost | dbname | Sleep | 3728 | | NULL |
| 112 | root | localhost | NULL | Sleep | 6 | | NULL |
+-----+---------+-----------+--------+---------+------+----------------+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
=====================================
110824 12:24:24 INNODB MONITOR OUTPUT
=====================================
Per second averages calculated from the last 19 seconds
----------
SEMAPHORES
----------
OS WAIT ARRAY INFO: reservation count 1521117, signal count 1471216
Mutex spin waits 0, rounds 20647617, OS waits 239914
RW-shared spins 2119697, OS waits 1037149; RW-excl spins 505734, OS waits 218177
------------
TRANSACTIONS
------------
Trx id counter 0 412917332
Purge done for trx's n:o < 0 412917135 undo n:o < 0 0
History list length 48
Total number of lock structs in row lock hash table 5
LIST OF TRANSACTIONS FOR EACH SESSION:
---TRANSACTION 0 0, not started, process no 28363, OS thread id 1092766032
MySQL thread id 83, query id 3249941 localhost root
---TRANSACTION 0 412901582, not started, process no 28363, OS thread id 1144449360
MySQL thread id 60, query id 3677008 localhost user
---TRANSACTION 0 412917189, not started, process no 28363, OS thread id 1144314192
MySQL thread id 43, query id 3905773 localhost root
---TRANSACTION 0 412534255, not started, process no 28363, OS thread id 1092630864
MySQL thread id 39, query id 14279 localhost user
---TRANSACTION 0 412917331, not started, process no 28363, OS thread id 1144179024
MySQL thread id 38, query id 3908045 localhost user
---TRANSACTION 0 412917201, not started, process no 28363, OS thread id 1092495696
MySQL thread id 13, query id 3908257 localhost user
---TRANSACTION 0 412538821, not started, process no 28363, OS thread id 1092360528
MySQL thread id 7, query id 3908258 localhost root
show engine innodb status
---TRANSACTION 0 412917330, ACTIVE 6 sec, process no 28363, OS thread id 1144043856
2 lock struct(s), heap size 368, undo log entries 1
MySQL thread id 2, query id 3907373 localhost root
COMMIT
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917331, sees < 0 412917131
---TRANSACTION 0 412917328, ACTIVE 6 sec, process no 28363, OS thread id 1092225360
2 lock struct(s), heap size 368, undo log entries 1
MySQL thread id 6, query id 3907345 localhost root
COMMIT
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917329, sees < 0 412917131
---TRANSACTION 0 412917326, ACTIVE 6 sec, process no 28363, OS thread id 1091955024
2 lock struct(s), heap size 368, undo log entries 1
MySQL thread id 4, query id 3907335 localhost root
COMMIT
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917327, sees < 0 412917131
---TRANSACTION 0 412917324, ACTIVE 6 sec, process no 28363, OS thread id 1092090192
2 lock struct(s), heap size 368, undo log entries 1
MySQL thread id 5, query id 3907328 localhost root
COMMIT
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917325, sees < 0 412917131
---TRANSACTION 0 412917321, ACTIVE (PREPARED) 7 sec, process no 28363, OS thread id 1143908688 preparing
2 lock struct(s), heap size 368, undo log entries 1
MySQL thread id 1, query id 3907125 localhost root
COMMIT
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917322, sees < 0 412917131
---TRANSACTION 0 412917131, ACTIVE 20 sec, process no 28363, OS thread id 1074075984, thread declared inside InnoDB 111
mysql tables in use 1, locked 0
MySQL thread id 40, query id 3904958 localhost user Sorting result
SELECT * FROM 'large_table' WHERE ('large_table'.'hotspot_id' = 3000064) ORDER BY discovered_at LIMIT 848000, 1000
Trx read view will not see trx with id >= 0 412917132, sees < 0 412917132
--------
FILE I/O
--------
I/O thread 0 state: waiting for i/o request (insert buffer thread)
I/O thread 1 state: waiting for i/o request (log thread)
I/O thread 2 state: waiting for i/o request (read thread)
I/O thread 3 state: waiting for i/o request (write thread)
Pending normal aio reads: 0, aio writes: 0,
ibuf aio reads: 0, log i/o's: 0, sync i/o's: 0
Pending flushes (fsync) log: 1; buffer pool: 0
3510225 OS file reads, 284998 OS file writes, 202897 OS fsyncs
1.05 reads/s, 21299 avg bytes/read, 8.10 writes/s, 7.58 fsyncs/s
-------------------------------------
INSERT BUFFER AND ADAPTIVE HASH INDEX
-------------------------------------
Ibuf: size 275, free list len 13392, seg size 13668,
489950 inserts, 491830 merged recs, 10986 merges
Hash table size 8850487, used cells 8127172, node heap has 32697 buffer(s)
71914.53 hash searches/s, 8701.91 non-hash searches/s
---
LOG
---
Log sequence number 157 3331524445
Log flushed up to 157 3331521939
Last checkpoint at 157 3326072846
1 pending log writes, 0 pending chkp writes
199025 log i/o's done, 7.53 log i/o's/second
----------------------
BUFFER POOL AND MEMORY
----------------------
Total memory allocated 4788954432; in additional pool allocated 1048576
Buffer pool size 262144
Free buffers 0
Database pages 229447
Modified db pages 1439
Pending reads 0
Pending writes: LRU 0, flush list 0, single page 0
Pages read 7453325, created 14887, written 118658
1.37 reads/s, 0.11 creates/s, 0.53 writes/s
Buffer pool hit rate 1000 / 1000
--------------
ROW OPERATIONS
--------------
1 queries inside InnoDB, 0 queries in queue
7 read views open inside InnoDB
Main thread process no. 28363, id 1091684688, state: flushing log
Number of rows inserted 1093064, updated 249134, deleted 1405, read 1115880534
7.89 inserts/s, 2.47 updates/s, 0.05 deletes/s, 80953.21 reads/s
----------------------------
END OF INNODB MONITOR OUTPUT
============================
EDITAR:
Obrigado por esclarecer isso.
Então eu tenho que dividir minha pergunta em dois casos agora.
É normal que o bloqueio nessa única tabela faça com que meu aplicativo inteiro seja "interrompido". O DB não deve ser responsivo para consultas a outras tabelas? Talvez algum buffer esteja definido muito baixo?
Mudará esta tabela para a ajuda do MyISAM? Eu não preciso de transações nessa mesa. Não haverá outros bloqueios em situações como essa (seleção longa + muitas inserções rápidas)?
EDIT2:
É assim que as consultas de inserção se parecem:
INSERT INTO 'large_table' ('device_address', 'hotspot_id', 'minute', 'created_at', 'updated_at', 'discovered_with_hci', 'hour', 'rssi', 'day', 'device_class', 'discovered_at') VALUES('10:40:03:90:10:40', 3000008, 1, '2011-08-22 05:01:08', '2011-08-22 05:01:08', -1, 5, -79, '2011-08-22 05:01:01', '0', '2011-08-22 05:01:01')
Isso é o que os índices são definidos nele:
+-------------+------------+----------------------------------------------+--------------+---------------------+-----------+-------------+----------+--------+------+------------+---------+
| Table | Non_unique | Key_name | Seq_in_index | Column_name | Collation | Cardinality | Sub_part | Packed | Null | Index_type | Comment |
+-------------+------------+----------------------------------------------+--------------+---------------------+-----------+-------------+----------+--------+------+------------+---------+
| large_table | 0 | PRIMARY | 1 | id | A | 92396334 | NULL | NULL | | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_discovered_with_hci | 1 | discovered_with_hci | A | 18 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_hotspot_id | 1 | hotspot_id | A | 18 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_day_and_hour_and_minute | 1 | day | A | 18 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_day_and_hour_and_minute | 2 | hour | A | 18 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_day_and_hour_and_minute | 3 | minute | A | 537187 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_created_at | 1 | created_at | A | 8399666 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
| large_table | 1 | index_large_table_on_rssi | 1 | rssi | A | 18 | NULL | NULL | YES | BTREE | |
+-------------+------------+----------------------------------------------+--------------+---------------------+-----------+-------------+----------+--------+------+------------+---------+
EDIT 3:
Por que, durante essas consultas, todo o meu aplicativo não está respondendo? Não deveria afetar apenas essa 'tabela_grande'?
Talvez algo esteja errado com minha configuração do mysql? O Server é um Xeon 2GHz de 4 núcleos com 16GB de RAM. Ele roda o MySQL + Rails App
Meus parâmetros de configuração:
skip-external-locking
key_buffer = 64M
max_allowed_packet = 16M
thread_stack = 128K
thread_cache_size = 8
query_cache_size = 32M
tmp_table_size = 64M
max_heap_table_size = 64M
table_cache = 256
read_rnd_buffer_size = 512K
sort_buffer_size = 2M
myisam-recover = BACKUP
max_connections = 200
query_cache_limit = 1M
long_query_time = 200
max_binlog_size = 100M
innodb_buffer_pool_size = 4G
safe-updates
max_join_size=100000000
O script Mysqltuner sugere apenas:
long_query_time (<= 10)
innodb_buffer_pool_size (>= 62G)
Resolvido!
O problema principal foi o query_cache. link
Depois de desativá-lo, o "congelamento" desaparece.
Por favor, olhe atentamente para a lista de processos e o 'status do innodb do show engine'. O que você vê ???
IDs de processo 1,2,4,5,6,13 estão tentando executar o COMMIT.
Quem está segurando tudo ??? O ID do processo 40 está executando uma consulta em large_table.
O ID do processo 40 está em execução há 33 segundos. IDs de processo 1,2,4,5,6,13 tendo funcionado menos de 33 segundos. O ID do processo 40 está processando algo. Qual é o problema?
Em primeiro lugar, a consulta está sendo usada em índice clusterizado via MVCC .
Dentro dos IDs de processo 1,2,4,5,6,13 são linhas que têm o MVCC Data protegendo seu isolamento de transação. O ID do processo 40 tem uma consulta que está passando por linhas de dados. Se houver um índice no campo hotspot_id, essa chave + a chave da linha real do índice clusterizado deverá executar um bloqueio interno. (Nota: Por design, todos os índices não exclusivos no InnoDB carregam tanto a sua chave (a coluna que você quis indexar) + uma chave de índice clusterizada). Este cenário único é essencialmente Força Imparável atende Objeto Imóvel.
Em essência, os COMMITs devem esperar até que seja seguro aplicar as alterações em large_table. Sua situação não é única, nem um fenômeno único, nem raro.
Na verdade, eu respondi três perguntas como esta no DBA StackExchange. As perguntas foram enviadas pela mesma pessoa relacionada ao mesmo problema. Minhas respostas não foram a solução, mas ajudaram o entrevistador a chegar a uma conclusão sobre como lidar com a situação dele.
Além dessas respostas, eu respondeu a pergunta de outra pessoa sobre deadlocks no InnoDB com relação aos SELECTs .
Espero que minhas postagens anteriores sobre esse assunto ajudem a esclarecer o que estava acontecendo com você.
ATUALIZAÇÃO 2011-08-25 08:10 EDT
Aqui está a consulta do ID do processo 40
SELECT * FROM 'large_table'
WHERE ('large_table'.'hotspot_id' = 3000064)
ORDER BY discovered_at LIMIT 799000, 1000;
Duas observações:
Você está fazendo 'SELECT *' você precisa buscar todas as colunas? Se você precisar apenas de colunas específicas, deverá rotulá-las porque a tabela temporária de 1000 linhas pode ser maior do que você realmente precisa.
As cláusulas WHERE e ORDER BY geralmente revelam problemas de desempenho ou fazem o design da tabela brilhar. Você precisa criar um mecanismo que acelere a coleta de chaves antes de coletar dados.
À luz dessas duas observações, há duas mudanças importantes que você deve fazer:
MUDANÇA PRINCIPAL # 1: refatorar a consulta
Redesenhe a consulta para que
Aqui está a nova consulta que faz essas três coisas
SELECT large_table.* FROM
large_table INNER JOIN
(
SELECT hotspot_id,discovered_at
FROM large_table
WHERE hotspot_id = 3000064
ORDER BY discovered_at
LIMIT 799000,1000
) large_table_keys
USING (hotspot_id,discovered_at);
A subconsulta large_table_keys reúne as 1000 chaves de que você precisa. O resultado da subconsulta é então INNER JOINed para large_table. Até agora, as chaves são recuperadas em vez de linhas inteiras. Isso ainda é 799.000 linhas para ler. Existe uma maneira melhor de obter essas chaves, o que nos leva a ...
MUDANÇA PRINCIPAL # 2: criar índices que suportam a consulta refatorada
Como a consulta refatorada apresenta apenas uma subconsulta, você só precisa criar um índice. Aqui está esse índice:
ALTER TABLE large_table ADD INDEX hotspot_discovered_ndx (hotspot_id,discovered_at);
Por que esse índice específico? Veja a cláusula WHERE. O hotspot_id é um valor estático. Isso faz com que todos os hotspot_ids formem uma lista sequencial no índice. Agora, observe a cláusula ORDER BY. A coluna discovered_at é provavelmente um campo DATETIME ou TIMESTAMP.
A ordem natural que isso apresenta no índice é a seguinte:
Fazer esse índice também elimina a classificação interna de tabelas temporárias.
Por favor, coloque essas duas grandes mudanças no lugar e você verá uma diferença no tempo de execução.
Experimente!
ATUALIZAÇÃO 2011-08-25 08:15 EDT
Eu olhei seus índices. Você ainda precisa criar o índice que eu sugeri.