Eu acredito que eu já vi isso uma vez com um cliente, e parecia ser apenas um bug do Storage Spaces. Em vez de ir à Microsoft para obter suporte no problema, eles optaram por apenas fazer backup / restaurar os dados e recriar o espaço de armazenamento e o disco virtual.
Isso não é um comportamento normal - substituir o disco físico deve permitir que você "substitua" e "conserte" sem problemas. Eu recomendaria entrar em contato com a Microsoft para relatar o erro / comportamento incorreto se isso for uma opção para você, caso contrário, você pode estar bloqueando a recriação e a restauração.
Ainda assim, como outros já mencionaram, você deve definitivamente tentar uma reinicialização. Eu também recomendo testar com um disco de substituição adicional. As sugestões de comando do Iulian no PowerShell também valem uma tentativa, mas elas não funcionaram para mim quando se deparou com esse problema.