A mistura de pacotes de diferentes versões geralmente não é possível (apenas em alguns casos especiais).
Normalmente, há muitas correções de erros durante as primeiras semanas após o lançamento, portanto, se a estabilidade for importante, espere algumas semanas antes de fazer o upgrade. Como o shintoist já escreveu, você não precisa usar o Unity com o Natty.
É sempre uma boa idéia experimentá-lo em um sistema ao vivo antes de atualizar para garantir que seu hardware suporte o novo sistema - para mim, um sistema ativo em uma chave USB funcionou sem problemas, em contraste com o autor do artigo você vinculou.