Kupfer é um programa orientado para teclado, por isso é estranho que de repente não responda a nenhuma tecla comandos . Uma vez que eu invoco, a janela aparece, mas nada que eu digite tem algum efeito.
Inicie o kupfer usando o comando kupfer --debug e tente novamente: isso não fará com que ele funcione, mas pelo menos lhe dará uma dica de por que ele não funciona.
É provável que algum plugin cause um erro impedindo que o kupfer funcione.
Eu tive esse problema com o plugin Empathy e isso me incomodou por horas.
Isso aconteceu comigo quando excluí uma pasta que estava no catálogo de pastas para o Kupfer monitorar. Eu tive que fazer uma desinstalação completa e reinstalar via synaptic para retomar a função normal.
O seu gerenciador de janelas tem "auto-raise" (foco automático de janelas enquanto o cursor se move sobre eles) ativado? Nesse caso, a menos que o mouse já esteja na área da tela onde o Kupfer se mostra, o foco será imediatamente revertido para qualquer janela em que o mouse esteja atualmente.