Não vejo por que isso seria um problema. Na verdade, eu diria que a maior parte da TI da área de saúde é executada em uma solução NoSQL chamada MUMPS. Você só precisa ter cuidado com a forma como foi implementado, mas o argumento para usar uma solução NoSQL faz muito sentido na área da saúde. Você pode ler mais sobre o MUMPS e possivelmente ser substituído pelas soluções NoSQL mencionadas acima:
Tenho certeza de que muitos gostariam que MUMPS saísse e que uma das soluções que você descreveu seja colocada em prática. Embora, até agora, não posso dizer que vi alguém fazer isso ainda.