Houve uma pergunta semelhante Configurar o iptables por SSH sem ficar bloqueado?
Eu posto aqui as dicas que dei na pergunta anterior:
1) Eu faço backup do arquivo de configuração antigo do iptables:
cp /etc/sysconfig/iptables /etc/sysconfig/iptables.bak
2) Antes de tentar as novas configurações, execute este comando para garantir que você possa se conectar novamente se algo nas novas configurações bloquear (basicamente substitui as regras antigas após 5 minutos):
echo "mv /etc/sysconfig/iptables.bak /etc/sysconfig/iptables && service iptables restart" | at now + 5min
3) Agora você pode modificar com segurança as regras do iptables. Se algo der errado, você pode se conectar em 5 minutos.