O DNS reverso só pode realmente ter um nome - se você listar mais de um, o DNS apenas fará um round-robin entre eles. Então você só precisa escolher um nome "oficial" para o servidor e usá-lo sempre. Todos os outros domínios são, em essência, apenas aliases para o original.
A maioria dos serviços não se importa com o nome que o seu servidor usa, eles apenas se importam que a pesquisa inversa retorne um nome de domínio que resolva corretamente indo para o outro lado também.