Em relação ao Linux de 64 bits: em muitos aspectos, o linux tem melhor suporte a 64 bits do que o Windows em que existem mais aplicativos-chave que são nativos em 64 bits. O Ubuntu melhorou muito nos últimos anos com relação ao suporte a 64 bits; flash está agora disponível no modo "preview" para suporte nativo de 64 bits. Além disso, o suporte de 32 bits com 64 bits geralmente funciona como um fallback.
Em relação a um IDE, eu recomendaria o Eclipse, se você estiver procurando por um IDE integrado em todos os idiomas. Tem o ecossistema de plugins mais rico (mais que VS). Mas, sendo um cara que considera "forçado" a usar o VS2010, eu pessoalmente gosto do gedit. O bom e velho gedit tem destaque de sintaxe para a maioria das linguagens (e pacotes disponíveis na comunidade para mais), e muitos plugins para completar código, completar brackets, etc ... É leve e fácil de usar. link