Qual sistema de arquivos você está executando? São dados de registro no diário ou apenas metadados? Pode ser que o tamanho do arquivo de log (metadados) seja estendido e a alteração seja registrada em diário, mas o conteúdo do log (dados) ainda não está escrito. Se o servidor travar ou reinicializar, os metadados serão reproduzidos a partir do diário, mas não haverá dados para recuperar, de modo que os conteúdos vazios (zero) serão mostrados. Você usa o TRIM no seu SSD? isso aumentaria a probabilidade de zero bytes (^ @)