Eu tive a chance de trabalhar com ambos sendo usados no mesmo datacenter durante um contrato no ano passado. Eu tive a chance de fazer algumas restaurações bare-metal com o NetBackup (que fiz várias vezes com o Backup Exec) e fazer algumas otimizações em dois ambientes diferentes do NetBackup. Algumas das observações que posso oferecer, com base nessa experiência, são as seguintes:
O NetBackup mostra claramente sua herança baseada em Unix. Eu sou um usuário de longa data do Backup Exec (claro quando era "Arcadia Backup Exec"), e inicialmente fiquei chocado com o quão íngreme foi a curva de aprendizado no NetBackup em comparação com o Backup Exec. Depois que consegui entender a "metáfora" do NetBackup e percebi que estava olhando para uma aplicação Unix antiga, no fundo, comecei a gostar muito de usá-la. É esperado que você seja capaz de escrever scripts, lidar com arquivos de configuração baseados em texto e ser capaz de diagnosticar problemas com o NetBackup. É muito poderoso, mas não necessariamente uma operação "apontar e clicar".
O Backup Exec possui uma herança do Windows e você não se encontra frequentemente fora da GUI. Ele faz um bom trabalho de backup de hosts e aplicativos do Windows. Eu usei isso para fazer backup de máquinas Netware (ick, ugh) sem problemas. Eu nunca tive a oportunidade de usar o suporte ao Linux, mas espero que seja decente.
Ambos os produtos são difíceis de lidar quando não funcionam adequadamente. O Backup Exec possui modos de depuração que facilitam o diagnóstico. O NetBackup é mais detalhado em sua saída, como é óbvio.
Se você pretende atualizar versões de hosts ou aplicativos ou obter novas unidades de fita, você deve contar com um contrato de suporte em ambos os produtos.
Se você quiser coisas como desduplicação de dados, melhor suporte a SAN, uma ampla variedade de sistemas operacionais host, streaming para várias unidades de fita simultaneamente (recentemente adicionado ao Backup Exec 12d, acredito, mas não tão testado quanto o NetBackup ) e dimensionamento massivo, o NetBackup é a sua escolha.
Se você for uma loja do Windows (ou, talvez, com apenas alguns servidores não-Windows) e as preocupações que descrevi acima não forem importantes, vá para o Backup Exec.
Ah-- e o NetBackup é muito mais caro que o Backup Exec.