Em vez de compilar a partir da origem e da implementação, crie (ou localize) pacotes do Ubuntu para as versões mais recentes que você precisa. Muitas vezes você pode pegar os arquivos de compilação de uma versão antiga e usar a nova fonte. Você pode então manter seus pacotes como qualquer outro, e só se preocupar em rastrear arquivos de configuração.
O Guia de Novos Mantenedores Debian é bastante útil nesta situação, especificamente Capítulo 9 - "Atualizando o pacote" . - embora pareça assustador no começo, pode ser tão simples quanto
- descompactar nova fonte
- aplicar arquivos de pacote
- atualizar o changelog
- compilação