Quando uma conexão SSH está ativa, ela está ativa. Você precisa desmontá-lo e recriar uma conexão SSH com as opções desejadas (com exceção do encaminhamento de porta, como mencionado na resposta de Mark Wagner). Há um recurso do OpenSSH 4.0+ que usa a ControlMaster
option para que novos comandos SSH reutilizem uma conexão existente, mas não é exatamente o que você quer.