Embora o IIS 7 ofereça suporte a filtros ISAPI, a Microsoft recomenda que você estenda a funcionalidade do servidor Web usando módulos em vez de usar filtros ISAPI.
Existe alguma razão pela qual você escolheu desenvolver algo no IIS 6 e agora está migrando para o IIS 7.5?
Você também seguiu o procedimento correto de instalar o filtro ISAPI no IIS 7.5, pois isso difere do IIS 6. Você pode compartilhar mais alguns detalhes sobre o seu filtro ISAPI e sua configuração?