Bem, isso é um meio estranho.
O principal é que o Windows / Hyper-V está se referindo a uma "lista" em algum lugar para informar quais máquinas virtuais estão registradas no servidor. Minhas máquinas virtuais estão espalhadas por várias unidades, então tem para ser um repositório centralizado. Que acaba por ser
C: \ ProgramData \ Microsoft \ Windows \ Hyper-V \ Máquinas Virtuais
existem links simbólicos que se referem às localizações físicas dos arquivos XML de configuração reais. Percebi que os links de VM problemáticos tinham um ícone de "bloqueio".
Eu editei a ACL de segurança do link simbólico problemático. Claro que não tem a conta NT Virtual Machine como o resto, então, em vez disso, eu concedi controle total para o grupo de usuários. Serviço de gerenciamento de máquina virtual do Hyper-V reiniciado, e ele pode carregar novamente as VMs ausentes. Parece funcionar sem as contas da máquina virtual.
Ainda não obtive as respostas completas e profundas que estava procurando para explicar exatamente o que o Hyper-V está exigindo dessas contas de máquina virtual, mas pelo menos a configuração original da máquina virtual pode ser reutilizada.