Não parece haver um limite documentado para o número de entradas crontab permitidas. Portanto, a menos que você verifique o código-fonte para a versão específica que está usando, talvez a entrada BUG na página do crontab possa ser útil:
Although cron requires that each entry in a crontab end in a newline character, neither the crontab command nor the cron daemon will detect this error. Instead, the crontab will appear to load normally. However, the command will never run. The best choice is to ensure that your crontab has a blank line at the end.