Você está usando a versão EPEL 5 do repositório em vez de 6, entra em seu arquivo /etc/yum.repos.d/epel.repo
e altera:
mirrorlist=http://mirrors.fedoraproject.org/mirrorlist?repo=epel-5&arch=$basearch
para
mirrorlist=http://mirrors.fedoraproject.org/mirrorlist?repo=epel-6&arch=$basearch
Em seguida, execute yum clean all
e tente instalar o munin novamente.
NOTA: você pode ter um problema com a chave GPG sendo diferente, você precisa pegar o EPEL6 ou apenas usar:
yum install munin --nogpgcheck