Algo que usamos é SQLH2 (Integridade e Histórico do SQL Server). Ele é criado como um add-on-pack da Microsoft e tem um bom conjunto de relatórios "get you go" para SQL Servers, e é gratuito!
Saúde do SQL Server e histórico do MSDN
Se você está apenas procurando verificações de saúde periódicas, pode configurar esses relatórios em um agendamento para enviá-los por e-mail para você semanalmente.
Se você começar a notar um problema, seja nos relatórios ou nos relatórios de usuários, você começará a analisar o Perfmon e o SQL Trace em busca de dicas e diagnósticos mais específicos.