O RAID de software é o RAID tratado pelos drivers no sistema operacional. Por definição, quando você está instalando um novo sistema operacional em discos configurados com software RAID, o novo sistema operacional vai ver os discos como "discos", em vez de como um volume RAID. (Um controlador RAID de hardware abstrai os discos no volume RAID e mostra ao SO um "disco" genérico.)
Se você está instalando o mesmo sistema operacional, ele deve "detectar" a configuração RAID de software existente e usá-la. Isso vai variar de sistema operacional para sistema operacional.
Editar:
Encontrar documentação oficial da Microsoft sobre isso está provando ser desnecessariamente difícil. Pelo que estou descobrindo, o Windows 7 Professional, Enterprise e Ultimate suportam o software RAID 0 e RAID 1. Minha experiência com versões anteriores de sistemas operacionais de clientes Windows era que nenhum RAID de software era permitido.