Acho que isso é causado porque já haverá um arquivo logrotate.pp no sistema ( /etc/selinux/targeted/modules/active/modules/logrotate.pp
).
Você deve criar sua política local com um nome diferente, por exemplo,
audit2allow -M MY_logrotate <somefilewithmessages
use então
semodule -i MY_logrotate.pp
para instalá-lo. Sim, não é a melhor das mensagens de erro.