Eu encontrei a resposta: no shell, dentro do diretório GlassFish com o GlassFish em execução, digite:
bin/asadmin create-system-properties \
org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.ENABLE_CLEAR_REFERENCES=false
Eu adicionei a barra invertida para formatar o comando em duas linhas, mas ele pode ser digitado sem ele em uma linha.