Você vai querer usar o ESEUtil. Não mudou muita coisa nas últimas 3 versões do Exchange.
Aqui está um guia sobre como usar o ESEUtil para fazer algumas verificações básicas de banco de dados no Exchange 2010: link
Por exemplo, para executar uma verificação de integridade em um banco de dados chamado priv1.edb localizado em D: \ Restore, tente:
ESEUTIL /G "D:\Restore\priv1.edb“
O ISINTEG é projetado especialmente para verificar a integridade dos repositórios do Exchange, mas acredito que ele só funcione em bancos de dados em um sistema Exchange em execução. O ESEUtil requer apenas os arquivos do banco de dados.