Se você quiser alterar as permissões, use este comando (755 concederá ao proprietário do arquivo permissões de leitura, gravação e execução, além de permissões de leitura e execução para agrupar e outros usuários):
sudo chmod -R 755 directory
Se você quiser alterar a propriedade de uma pasta e suas subpastas e arquivos
sudo chown -R username:usergroup directory
Se o proprietário de um arquivo ou diretório for digamos que o usuário jofrey
deseja conceder a ele permissões de leitura e gravação:
sudo chmod -R u+rw directory
Você pode saber mais sobre os números de permissão e o que eles significam a partir dessa imagem