O Webalizer é muito bom para minerar seus logs do Apache para estatísticas - quem visita, de que Endereços IP, um detalhamento dos tipos de domínios que esses IPs resolvem de forma inversa (.com, .net, .co.uk, .ru, etc.), o que seus navegadores afirmam ser (que é geralmente, embora nem sempre, o que eles realmente são), qual sistema operacional o usuário está usando (novamente, desde que o navegador esteja reportando honestamente), etc., etc. É completamente não intrusivo; nada de especial em suas páginas da web, nenhuma solicitação adicional para servidores externos em cada página carregada, etc.
OGoogle Analytics , por outro lado, funciona no nível do cliente. Cada página do seu site chama o Google Analytics por meio de uma tag de script para que eles possam capturar essas informações para você (e muito mais). Morto fácil de usar, mas incorre em uma solicitação extra para seus servidores em cada carregamento de página. Além disso, observe que alguns bloqueadores de publicidade também bloqueiam o Google Analytics. e GA requer Javascript, que alguns (embora não muitos) podem ter desativado.
Esses seriam dois dos maiores, cada um com sua abordagem diferente. O Webalizer, sendo inteiramente local (e, portanto, privado) e não intrusivo, pode ser atraente; os recursos de escopo e análise do GA podem ser atraentes.