Para revisão de código, usamos o ReviewBoard , que é muito mais maduro do que outros. Eu acho que é uma boa idéia instalar algo como Laconi.ca internamente para que as pessoas possam postar atualizações rápidas sobre seu trabalho.
Eu também recomendo uma ferramenta de gerenciamento de projetos como Basecamp , um bug tracker como Lighthouse ou se você puder pagar, o venerável FogBugz que é excelente.
Você também pode adicionar FreeNAS para uma boa caixa de armazenamento NAS.
Caso contrário, você praticamente cobriu tudo:)