resposta curta: não se preocupe. Não há necessidade de particionar.
resposta mais longa: certifique-se de que não há nada em que ainda esteja interessado nos discos rígidos conectados aos hosts nos quais você instala o ESXi ao instalar. O ESXi aplicará um formato padrão para seu próprio material (gerenciamento) e criará um "armazenamento de dados" a partir do espaço restante.
observação sobre nomenclatura:
ESX e ESXi armazenam "coisas" do hipervisor que precisam rodar em partições geralmente não visíveis no VI Client. Você consegue ver os resultados que vêm de lá, como entradas de log, mas geralmente você não está se movendo por lá sozinho (a menos que você faça login explicitamente na CLI no host ESX). Essas partições geralmente são conectadas localmente em um host ESX / i, pois são usadas apenas por um único host.
Máquinas virtuais e tais são armazenadas em partições separadas, chamadas de "armazenamentos de dados", e normalmente você as coloca em um armazenamento compartilhado para que todos conectados ao SAN / NAS possam ver e usar o armazenamento de dados. No entanto, o armazenamento de dados pode residir em praticamente todos os lugares - também em discos rígidos locais. Nesse caso, outro host não seria capaz de montar o armazenamento de dados, mas ainda é um armazenamento de dados perfeitamente avlido.
Para compartilhar discos conectados localmente com outros hosts do ESXi, consulte o vSphere Storage Appliance .