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Você provavelmente poderia remover o serviço de mensagens do indicador, mas isso não economizaria muito.
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Outra opção seria executar a unidade 2d ou o gnome-classic a partir da tela de login. Os desktops 3d usam mais computadores para fazer "composição" e os softwares mais novos tendem a consumir mais recursos do que os softwares mais antigos. O Unity usa compiz para fazer sua composição e parece acumular tempo de CPU notável no meu laptop.
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Da próxima vez que você quiser instalar o Ubuntu, você poderá instalar o sabor Xubuntu do Ubuntu. É construído para ser mais leve.