É uma maneira muito comum de fazer isso. Faz sentido em várias maneiras
- Todos os bancos de dados estão no mesmo servidor para que o backup seja mais fácil
- Você pode ter um servidor de banco de dados seguro e de back-end, não conectado diretamente à Internet e acessível apenas pelos servidores da web
- Você pode especificar seu servidor de banco de dados para que ele seja grande o suficiente para lidar com o processamento de dados, deixando os servidores front-light leves e processando tarefas da web