Eu não posso responder a todas as suas perguntas, mas pelo que você descreve, parece que a sua placa de som tem opções que estão sendo alteradas pelo ALSA e não foram alteradas quando você desligou.
Execute alsamixer
no terminal e certifique-se de que o sensor não esteja mudo. Você também pode ajustar quaisquer outras configurações conforme necessário a partir delas, e elas continuarão com as reinicializações - resolvendo assim seus problemas no Windows.