Existem algumas desvantagens. Nao muitos. Provavelmente não o suficiente para compensar as vantagens de ter um software RAID.
- O desempenho diário vai sofrer ... minimamente ... provavelmente não notadamente
- Reconstruir o RAID vai matar o desempenho ... provavelmente muito ...
- Os RAIDs de software normalmente não oferecem capacidade de troca a quente, o que significa que uma unidade com falha requer tempo de inatividade
- O RAID depende do SO ... não é grande coisa para a maioria, mas algumas pessoas precisam de inicialização dupla.
- Discos dinâmicos não funcionam tão bem com ferramentas de recuperação
Tudo o que disse, você tem as vantagens da portabilidade de hardware, não ter uma placa RAID como ponto de falha e preços muito melhores. Eu sou realmente um fã de software RAID 1 (desde que eu não precise de hotswapping) ... não muito fã de software RAID 5, mas essa não era a questão: -)