Parece que você já tem o kernel mais atualizado
kernel-2.6.32-431.20.3.el6.x86_64
no seu sistema, então yum está correto, pois não há nada a fazer. No entanto, este kernel não está ativo.
uname -r
2.6.32-358.11.1.el6.x86_64
Você precisará reinicializar seu sistema para ativá-lo.