Seu plano deve funcionar bem. Com isso dito, eu ainda aconselharia backups;)
Minha versão atual do 11.10 está repleta de erros de desligamento / reinicialização que são basicamente não-fixáveis por causa de algo que fiz meses atrás. Juntamente com erros de totem, mau funcionamento de arquivos recentes ... etc.
Quando o 12.04 sai no final de abril, decidi ficar com o Ubuntu em vez de mudar para o Mac. Meu sistema de arquivos tem o seguinte em partições diferentes:
/
(swap)
/home
/home/Videos
/home/Television
Quando gravo e executo o disco de instalação do 12.04, apenas seleciono as partições anteriores no modo avançado e escolho reformatar o root /
para executar uma instalação limpa? Eu não me importo com os pacotes de aplicativos que perco, posso facilmente baixá-los novamente.
Seu plano deve funcionar bem. Com isso dito, eu ainda aconselharia backups;)