Isso pode ser feito com um SHOW PROCESSLIST;
razoavelmente básico da CLI do MySQL como um usuário administrativo do MySQL.
Se houver um processo que precisa ser encerrado, um simples KILL <query Id>;
deve cuidar disso.
Não há nada acontecendo para essa caixa de dev, mas é um exemplo do que você veria na saída:
mysql> show processlist;
+----+------+-----------+--------+---------+------+-------+------------------+
| Id | User | Host | db | Command | Time | State | Info |
+----+------+-----------+--------+---------+------+-------+------------------+
| 7 | root | localhost | wikidb | Query | 0 | NULL | show processlist |
+----+------+-----------+--------+---------+------+-------+------------------+
Como você pode ver, ele exibe informações úteis sobre o banco de dados que executa a consulta, o tempo de execução, o status da consulta e o conteúdo da consulta.