Primeiro, leia este responda aqui . Você terá que configurar seu firewall e usar outros meios para fornecer proxy como configuração automática. O IPV6 não fornece nenhum NAT, portanto, não há interceptação de tráfego, e não há proxies transparentes.
O wiki do Squid tem um patch do Tproxy mas parece um truque para mim, você pode tentar, mas eu nunca testei .
Outras soluções como o WCCP da CISCO também foram muito conectadas ao ipv4 e não funcionarão no ipv6, mas provavelmente serão atualizado (ou algo vai aparecer para substituir).