No processo, veja o lsof -p <pid>
Você está procurando por FD 13
i.e. de uma das minhas implantações do httpd.
httpd 10865 apache 13w REG 8,5 1113187 59310687 /var/log/httpd/some_site.log
Eu observaria a contenção com a obtenção de um bloqueio exclusivo no arquivo, observado no FD 13 neste caso, se outros processos disputarem bloqueios, como observado por fcntl, isso explicaria sua longa espera.