É claro que a maioria dos gerenciadores de janela (veja Qual é a diferença entre um ambiente de desktop e um gerenciador de janelas? ) oferece teclas de atalho para alterar a posição e o tamanho da janela, mas com wmctrl
você pode controlar essas coisas simplesmente por si mesmo, por exemplo
wmctrl -r :ACTIVE: -e 0,200,200,640,480
para alterar o tamanho da janela ativa para 640x480px e posicioná-la em 200, 200. Consulte man wmctrl
para toda a história.
Depois de descobrir os comandos que deseja, basta atribuí-los ao atalho desejado usando a GUI do seu ambiente de trabalho.