Certamente pode. Uma resposta definitiva para a questão de saber se sua CPU subiu por causa disso exigiria mais informações, mas, em geral, isso é bastante comum e facilmente explicável.
As cargas de trabalho dos servidores precisam esperar muito - a CPU e a memória, sendo locais, geralmente precisam esperar por coisas como rede e armazenamento. Eu tive aplicativos enlouquecendo se tornando CPU ligado depois de obter acesso a um SSD, por exemplo.
É muito possível que seu aplicativo esteja recuperando dados do armazenamento aprimorado muito mais rápido do que antes que a CPU se tornou o gargalo.