xtrabackup é muito diferente do mysqldump. Ele não gera um dump de dados de esquema que é "restaurado" - na verdade, ele abre suas tabelas com uma cópia em execução do InnoDB e gera dados de tablespace que são diretamente utilizáveis pelo MySQL. Para a maioria dos propósitos, ele se comporta como um backup frio de seu diretório de dados. Depois de aplicar incrementais, não há nenhum procedimento de restauração real envolvido com o xtrabackup além de simplesmente copiar o backup no lugar e iniciar o MySQL.
O que pode funcionar é exportar e importar tabelas individuais conforme descrito no link . Eu não verifiquei que isso funcionará entre esquemas de nomes diferentes, mas não consigo pensar em uma razão para isso.