A resposta (para mim) é simplesmente criar um instantâneo temporário do LVM, usar qualquer qualquer técnica de backup incremental e, em seguida, descartar o instantâneo.
Quanto à segurança dos instantâneos do LVM (que eu normalmente tenho que fazer enquanto o DB está rodando), estou bastante confiante de que eles funcionarão bem. Para cobrir o risco residual, estou encerrando o banco de dados uma vez por semana antes de fazer um backup completo.