Acabei de encontrar a ferramenta que funciona de maneira perfeita! É ainda melhor do que o MoueImp no Windows e funciona globalmente em qualquer lugar que você tenha uma barra de rolagem.
É chamado Gpointing e pode ser instalado a partir do Ubuntu Software-Center ou digitando
sudo apt-get install gpointing-device-settings
em um terminal.
Você precisa iniciar a ferramenta, ativar a emulação do mouse e escolher o botão do mouse desejado (o botão direito é o número 3 no meu caso).
A ferramenta também parece ser ótima para os usuários do touchpad, já que permite personalizar muitas coisas, como a rolagem com movimentos circulares no touchpad (muito útil em páginas grandes).