você verificou o wait
tempo? o que diz iostat
? Se você tem um gargalo de armazenamento, às vezes ele aparece com alto uso de CPU.
Eu tenho um servidor de arquivos ocupado com o Samba para 30-50 clientes Mac simultâneos (todos com Gigabit Ethernet, trabalhando com enormes arquivos do Photoshop) em um CPU dual core modesto. O maior fator foi RAM (para cache). Cada vez que o número ou a carga de trabalho dos usuários aumentava, adicionei RAM extra e o uso da CPU, conforme relatado pela maioria das ferramentas, diminuiu drasticamente e a responsividade permaneceu alta.