nah as alterações do esquema serão replicadas. Isso não forçará a assinatura a reinicializar. Os clientes são todos sql server 2005, certo?
Você provavelmente deve verificar se as alterações do esquema de replicação estão definidas como verdadeiras para a publicação.
Eu também testei isso no meu ambiente de laboratório no SQL Server 2005 para ter certeza. Você deveria criar um, em vez de confiar em outras pessoas.